Por Junior Passos, contador · Passos & Fernandes Contabilidade Consultiva, especializada em saúde · Salvador/BA · atualizado em 2026
Abrir uma clínica médica em Salvador tem quatro blocos de custo: a constituição da empresa, as licenças obrigatórias, a estrutura física com equipamentos e o capital de giro dos primeiros meses. Da parte burocrática, um valor é tabelado e público: a constituição de Sociedade Limitada na Junta Comercial do Estado da Bahia custa R$ 360,00, conforme a tabela oficial da capital, atualizada em janeiro de 2026. O restante depende do porte, da especialidade e do ponto escolhido, e precisa ser orçado. Mas existe uma decisão que pesa mais no bolso do que todo o custo de abertura somado: o regime tributário. No exemplo deste artigo, a escolha certa representa quase R$ 59 mil por ano de diferença, todo ano. Abaixo, a conta completa.
Resumo rápido
- A taxa da JUCEB é tabelada: R$ 360,00 para constituição de Sociedade Limitada na capital.
- Licenças, estrutura e equipamentos variam muito conforme a especialidade e o porte, e precisam ser orçados.
- A licença da vigilância sanitária é obrigatória e é o item que mais atrasa a inauguração, porque depende de vistoria.
- A clínica precisa de registro próprio no CRM-BA, com responsável técnico.
- A decisão de regime tributário pesa mais que o custo de abrir: para uma clínica que fatura R$ 80 mil por mês, a diferença entre o melhor e o pior cenário passa de R$ 4.800 por mês.
- Clínicas que realizam procedimentos podem pleitear a equiparação hospitalar, que reduz a base do IRPJ e da CSLL.
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Quais são os custos de abrir uma clínica médica?
Os gastos se dividem em quatro blocos. Só o primeiro é previsível de fora; os demais dependem do seu projeto.
| Item | O que é | Valor |
|---|---|---|
| Constituição na JUCEB | Registro do contrato social na Junta Comercial do Estado da Bahia. Vale tanto para a clínica com sócios quanto para a Sociedade Limitada Unipessoal. | R$ 360,00 valor tabelado |
| Certificado digital | Obrigatório para assinar documentos, emitir nota fiscal e cumprir obrigações. | Varia conforme a certificadora e o tipo (A1 ou A3) |
| Registro da clínica no CRM-BA | A pessoa jurídica precisa de registro próprio no Conselho Regional de Medicina, com responsável técnico indicado. | Consulte a taxa e a anuidade vigentes no CRM-BA |
| Alvará de funcionamento | Licença da Prefeitura de Salvador para operar no endereço, ligada à inscrição municipal e ao ISS. | Calculado conforme a atividade e o porte do imóvel |
| Licença da vigilância sanitária | Obrigatória para estabelecimentos de saúde, com exigências de estrutura, fluxo, esterilização e descarte de resíduos. | Varia conforme o porte e a classificação de risco |
| Estrutura e equipamentos | Reforma e adequação às normas sanitárias, mobiliário e equipamentos da especialidade. Costuma ser o maior investimento. | Depende inteiramente da especialidade |
| Capital de giro | Reserva para os primeiros meses, enquanto a agenda ainda não está cheia e os convênios demoram a pagar. | Planejar conforme o ponto de equilíbrio |
A taxa da JUCEB consta da tabela de preços oficial da Junta Comercial do Estado da Bahia para a capital (última atualização em 21/01/2026). Os demais itens não têm valor único: dependem da especialidade, do porte e do ponto. Preferimos não publicar um “investimento médio” chutado, porque uma clínica de dermatologia e uma de ortopedia não têm o mesmo custo, e um número redondo só serviria para te enganar. O caminho certo é montar o orçamento do seu projeto.
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Por que a vigilância sanitária define o seu prazo de inauguração
De todos os itens, a licença sanitária é a que mais atrasa, porque depende de vistoria e de adequação física do espaço. E o erro mais caro do processo é justamente aqui: alugar o ponto e fazer a reforma antes de saber o que a vigilância vai exigir.
Quando a exigência aparece com a obra pronta, a correção sai muito mais cara, e a inauguração escorrega meses. Os pontos que costumam gerar retrabalho:
- Layout e fluxo: separação entre recepção, atendimento, área suja e área limpa;
- Esterilização: quando há procedimentos, estrutura e controles próprios;
- Resíduos: plano de gerenciamento de resíduos de serviços de saúde, com contrato de coleta;
- Acessibilidade e adequações do imóvel;
- Equipamentos com exigência específica, como os de imagem, que envolvem proteção radiológica;
- Responsável técnico médico, inscrito e regular no CRM-BA.
A ordem certa é levantar as exigências da especialidade antes de assinar o contrato de locação. Um ponto barato que não comporta as adequações sai mais caro que um ponto adequado.
O erro que custa mais caro não é na obra, é no regime tributário
Aqui está o ponto que a maioria dos sócios descobre tarde demais. Todo o custo de abertura é pago uma vez. O regime tributário é pago todo mês, para sempre. E a diferença entre escolher certo e escolher no automático costuma superar, em um único ano, tudo o que se gastou para abrir.
Veja uma clínica que fatura R$ 80 mil por mês, nos três cenários possíveis:
| Cenário (fatura R$ 80.000/mês) | Imposto por mês | Carga |
|---|---|---|
| Lucro Presumido com equiparação hospitalar | ~R$ 7.140 | ~8,9% |
| Simples Nacional (Anexo III, Fator R) | ~R$ 9.830 | ~12,3% |
| Lucro Presumido sem equiparação | ~R$ 12.020 | ~15,0% |
Repare na inversão. Para o médico que atende sozinho, o Simples costuma ser o melhor caminho. Para a clínica com procedimentos e estrutura, o Lucro Presumido com equiparação hospitalar pode ficar abaixo do Simples. Entre o melhor e o pior cenário desta tabela há quase R$ 4.900 por mês, quase R$ 59 mil por ano.
Valores ilustrativos para 2026, considerando as regras do Simples Nacional (Anexo III com Fator R) e do Lucro Presumido, com ISS de 3% apenas como ilustração. A alíquota de ISS varia conforme o município e a atividade, e o resultado exato depende do faturamento, da folha e dos procedimentos realizados.
O que é a equiparação hospitalar e quem tem direito
No Lucro Presumido, o IRPJ e a CSLL de prestadores de serviço incidem sobre uma base presumida de 32% do faturamento. A equiparação hospitalar reduz essa base para 8% no IRPJ e 12% na CSLL, o que derruba os dois tributos.
Na tabela acima, é exatamente isso que acontece: o IRPJ cai de cerca de R$ 3.840 para R$ 960, e a CSLL de R$ 2.304 para R$ 864, sem que nada mais mude.
Não é para toda clínica. O enquadramento depende de a clínica realizar procedimentos previstos e de possuir estrutura compatível com as exigências, incluindo a regularidade sanitária. É justamente por isso que a decisão precisa ser analisada caso a caso, com a documentação certa desde a abertura. Muita clínica que teria direito nunca pleiteou, simplesmente porque ninguém olhou.
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Quanto custa manter a clínica depois de aberta?
O investimento de abrir é pontual. O que define se a clínica é lucrativa são os custos recorrentes:
- Aluguel e condomínio do ponto;
- Equipe: recepção, técnicos, enfermagem, com todos os encargos;
- Impostos: a maior linha, conforme a tabela acima;
- Materiais e manutenção de equipamentos, com calibrações periódicas;
- Sistema de gestão e emissão de notas;
- Renovações: licença sanitária, anuidade do CRM-PJ e certificado digital;
- Contabilidade: o acompanhamento da empresa, que se paga pelo imposto que o enquadramento correto economiza.
Repare na proporção: entre todas essas linhas, o imposto é a maior. É por isso que a decisão de regime não é detalhe contábil, é decisão de sócio.
Como abrir a clínica na ordem certa
- 1. Levantar as exigências sanitárias da sua especialidade, antes de fechar a locação;
- 2. Definir a estrutura societária: sociedade entre médicos ou unipessoal, capital social, participação de cada sócio e regras de distribuição de lucros;
- 3. Definir o regime tributário com simulação, incluindo a análise de equiparação hospitalar;
- 4. Registrar na JUCEB e obter o CNPJ;
- 5. Inscrição municipal na Prefeitura de Salvador, para o ISS e a emissão de nota;
- 6. Certificado digital;
- 7. Registro da clínica no CRM-BA com responsável técnico;
- 8. Alvará de funcionamento e licença sanitária;
- 9. Cadastros complementares exigidos para estabelecimentos de saúde e, se houver convênios, o credenciamento junto às operadoras.
Um alerta sobre o passo 2: quando há sócios, o contrato social precisa tratar de distribuição de lucros, entrada e saída de sócios e responsabilidades. Contrato genérico, baixado de modelo, é fonte de briga futura e pode custar a sociedade inteira.
Quando vale a pena abrir a clínica?
A clínica passa a fazer sentido quando o volume de atendimentos já não cabe no consultório individual, quando há sócios dividindo estrutura, ou quando a especialidade exige equipamentos que só se pagam com escala. Antes disso, o consultório costuma ser mais eficiente.
O sinal financeiro é simples: se a estrutura projetada só se paga com a agenda cheia desde o primeiro mês, o projeto está apertado demais. O plano precisa suportar uma curva de maturação, e é aí que o capital de giro entra.
Conclusão
Abrir uma clínica médica em Salvador tem um custo tabelado (R$ 360,00 de constituição na JUCEB) e vários outros que dependem da especialidade, do porte e do ponto, e por isso precisam ser orçados, não estimados por um número redondo.
Mas o número que mais pesa não está na abertura. Está na decisão de regime tributário, que se repete todo mês. No exemplo deste artigo, a diferença entre o melhor e o pior cenário passa de R$ 59 mil por ano. Definir isso antes do primeiro faturamento, com simulação e análise de equiparação hospitalar, é o que separa a clínica que lucra da que trabalha muito e vê pouco.
Na Passos & Fernandes somos especializados em clínicas e profissionais da saúde, aqui em Salvador. Conduzimos a abertura completa e fazemos o diagnóstico tributário antes de a clínica começar a faturar.
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Passos & Fernandes · R. Alceu Amoroso Lima, 668, Caminho das Árvores, Salvador/BA · (71) 98872-0540 · contato@passosefernandes.com.br
Perguntas frequentes
Quanto custa abrir uma clínica médica em Salvador?
O único valor tabelado é a constituição da empresa na Junta Comercial: R$ 360,00 para Sociedade Limitada na capital, conforme a tabela oficial da JUCEB. Licenças, estrutura, equipamentos e capital de giro variam conforme a especialidade e o porte, e precisam ser orçados no seu projeto.
Qual o melhor regime tributário para clínica médica?
Depende dos procedimentos e da estrutura. Clínicas que realizam procedimentos e conseguem a equiparação hospitalar podem pagar menos no Lucro Presumido do que no Simples Nacional. No exemplo deste artigo, a equiparação resultou em 8,9% contra 12,3% do Simples. A definição exige simulação com os seus números.
O que é a equiparação hospitalar?
É o enquadramento que reduz a base de cálculo presumida do IRPJ de 32% para 8% e da CSLL de 32% para 12%, no Lucro Presumido. Depende de a clínica realizar procedimentos previstos e ter estrutura compatível com as exigências, incluindo regularidade sanitária.
A clínica precisa de registro no CRM?
Sim. Além do registro pessoal de cada médico, a pessoa jurídica precisa de registro próprio no Conselho Regional de Medicina, com responsável técnico indicado.
Qual etapa mais atrasa a abertura?
A licença da vigilância sanitária, porque depende de vistoria e de adequação física. Por isso ela deve ser a primeira exigência levantada, antes mesmo de fechar o contrato de locação do ponto.
Vale mais a pena abrir clínica ou continuar no consultório?
A clínica faz sentido quando o volume não cabe mais no consultório individual, quando há sócios dividindo estrutura ou quando a especialidade exige equipamentos que só se pagam com escala. Antes disso, o consultório costuma ser mais eficiente.
